Vou entrar aqui para colocar um pouco de fogo na fogueira. srsrsrs
Sobre o Samba, o Endian também o possui, não apenas para integração com o AD, mais também da a opção de compartilhamento de arquivos, porem ele é mais "escondido" do que no Zentyal, visto que todo o gerenciamento tem que ser feito pelo SSH.
Eu instalei o Zentyal e pelo pouco que eu utilizei, achei ele mesmo sendo bem interessante, um pouco mais complicado de fazer gerenciamento do que o Endian.
Porem sobre o ponto do Eduardo, sobre ele não ser tão seguro por ser filho do Ubuntu, eu concordo e descordo ao mesmo tempo (tem como? TEM!!!). O Ubuntu em si, mesmo utilizando pacotes mais novos, tem se mostrado para mim (um antigo esculhambador desta distro para servidores), como uma distro com futuro na área, tanto que até mesmo a Dell está utilizando ela ao invés do Red Hat em suas nuvens privadas. Porem uma coisa que o Zentyal tem que sou TOTALMENTE contra, é o sistema desktop ativo por padrão. 70% dos bugs em uma maquina linux ocorrem com programas gráficos e interface gráfica. Ou seja, utilizando a interface gráfica por padrão, acaba não só ganhando mais brechas de segurança, como tomando processador/memoria do que realmente importa, as aplicações do servidor.